Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spta1P08032 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spta1P08032 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spta1P08032 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spta1P08032 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spta1P08032 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spta1P08032 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spta1P08032 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spta1P08032 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Spta1P08032 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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