Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prp2P05143 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prp2P05143 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prp2P05143 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prp2P05143 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prp2P05143 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prp2P05143 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prp2P05143 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prp2P05143 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prp2P05143 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prp2P05143 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prp2P05143 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prp2P05143 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prp2P05143 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prp2P05143 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prp2P05143 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prp2P05143 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms