Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01789 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01789 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01789 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01789 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01789 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01789 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01789 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01789 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01789 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01789 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01789 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01789 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01789 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01789 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01789 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01789 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01789 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01789 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01789 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01789 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01789 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01789 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01789 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01789 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01789 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01789 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01789 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01789 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01789 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01789 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01789 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01789 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01789 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01789 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01789 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01789 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01789 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01789 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01789 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01789 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01789 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01789 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01789 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01789 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01789 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01789 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01789 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01789 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01789 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01789 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01789 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01789 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01789 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01789 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01789 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01789 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01789 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01789 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01789 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01789 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01789 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01789 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01789 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01789 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01789 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01789 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01789 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01789 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01789 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01789 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01789 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01789 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01789 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01789 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01789 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01789 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms