Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01786 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01786 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01786 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01786 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01786 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01786 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01786 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01786 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01786 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01786 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01786 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01786 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01786 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01786 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01786 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01786 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01786 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01786 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01786 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01786 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01786 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01786 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01786 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01786 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01786 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01786 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01786 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01786 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01786 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01786 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01786 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01786 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01786 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01786 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01786 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01786 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01786 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01786 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01786 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01786 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01786 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01786 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01786 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01786 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01786 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01786 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01786 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01786 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01786 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01786 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01786 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01786 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01786 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01786 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms