Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01736 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01736 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01736 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01736 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01736 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01736 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01736 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01736 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01736 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01736 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01736 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01736 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01736 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01736 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01736 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01736 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01736 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01736 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01736 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01736 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01736 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01736 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01736 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01736 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01736 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01736 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01736 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01736 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01736 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01736 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01736 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01736 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01736 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01736 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01736 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01736 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01736 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01736 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01736 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01736 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01736 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01736 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01736 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01736 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01736 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01736 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01736 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01736 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01736 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01736 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01736 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01736 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01736 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01736 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01736 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01736 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01736 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01736 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01736 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01736 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01736 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01736 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01736 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01736 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01736 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01736 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01736 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01736 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01736 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01736 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01736 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01736 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01736 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01736 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01736 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01736 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01736 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2109.3 ms