Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01661 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01661 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01661 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01661 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
P01661 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01661 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01661 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01661 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01661 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01661 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01661 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01661 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01661 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01661 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01661 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01661 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01661 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01661 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01661 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01661 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01661 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01661 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01661 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01661 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01661 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01661 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01661 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01661 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01661 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01661 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01661 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01661 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
P01661 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01661 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01661 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01661 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01661 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01661 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01661 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01661 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01661 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01661 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01661 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01661 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01661 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01661 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01661 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01661 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01661 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01661 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01661 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01661 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01661 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01661 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01661 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01661 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01661 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01661 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01661 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01661 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01661 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01661 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
P01661 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01661 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01661 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01661 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P01661 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01661 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01661 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01661 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01661 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01661 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01661 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
P01661 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01661 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01661 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
P01661 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01661 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01661 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01661 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01661 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01661 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01661 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01661 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01661 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01661 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01661 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01661 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms