Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01646 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01646 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01646 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P01646 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01646 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01646 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01646 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01646 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01646 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01646 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01646 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01646 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01646 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01646 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01646 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01646 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
P01646 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01646 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01646 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01646 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01646 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01646 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01646 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01646 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01646 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01646 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01646 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01646 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
P01646 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01646 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01646 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01646 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01646 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01646 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01646 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01646 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01646 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01646 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
P01646 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01646 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01646 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01646 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01646 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P01646 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01646 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P01646 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01646 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01646 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01646 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01646 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01646 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01646 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
P01646 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01646 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01646 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01646 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01646 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01646 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01646 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01646 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01646 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01646 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01646 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01646 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01646 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01646 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01646 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01646 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P01646 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01646 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01646 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01646 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P01646 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P01646 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01646 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01646 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01646 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01646 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01646 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01646 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01646 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
P01646 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01646 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01646 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
P01646 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01646 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01646 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01646 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01646 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01646 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01646 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01646 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01646 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01646 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01646 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01646 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01646 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01646 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01646 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms