Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnb1P01575 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnb1P01575 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms