Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtatp6P00848 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mtatp6P00848 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtatp6P00848 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms