Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdc6O89033 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc6O89033 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc6O89033 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdc6O89033 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 387.8 ms