Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Robo1O89026 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Robo1O89026 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Robo1O89026 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Robo1O89026 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Robo1O89026 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Robo1O89026 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Robo1O89026 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Robo1O89026 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Robo1O89026 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Robo1O89026 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Robo1O89026 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Robo1O89026 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Robo1O89026 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Robo1O89026 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Robo1O89026 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Robo1O89026 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms