Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Slc27a3O88561 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc27a3O88561 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc27a3O88561 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc27a3O88561 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms