Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cops6O88545 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cops6O88545 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cops6O88545 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cops6O88545 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cops6O88545 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cops6O88545 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cops6O88545 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cops6O88545 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cops6O88545 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cops6O88545 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cops6O88545 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cops6O88545 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms