Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme6O88425 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme6O88425 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme6O88425 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme6O88425 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme6O88425 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nme6O88425 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nme6O88425 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nme6O88425 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme6O88425 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nme6O88425 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme6O88425 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nme6O88425 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme6O88425 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme6O88425 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nme6O88425 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme6O88425 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme6O88425 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme6O88425 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme6O88425 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nme6O88425 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nme6O88425 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms