Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm6aO70546 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm6aO70546 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm6aO70546 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm6aO70546 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm6aO70546 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm6aO70546 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm6aO70546 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm6aO70546 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm6aO70546 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm6aO70546 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm6aO70546 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm6aO70546 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms