Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hcn4O70507 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hcn4O70507 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcn4O70507 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcn4O70507 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms