Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfnO70456 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfnO70456 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfnO70456 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfnO70456 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfnO70456 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfnO70456 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfnO70456 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfnO70456 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfnO70456 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfnO70456 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfnO70456 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfnO70456 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfnO70456 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SfnO70456 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SfnO70456 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SfnO70456 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SfnO70456 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfnO70456 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfnO70456 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfnO70456 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfnO70456 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfnO70456 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfnO70456 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SfnO70456 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfnO70456 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfnO70456 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfnO70456 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfnO70456 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfnO70456 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfnO70456 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfnO70456 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SfnO70456 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SfnO70456 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SfnO70456 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SfnO70456 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SfnO70456 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SfnO70456 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfnO70456 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfnO70456 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfnO70456 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfnO70456 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfnO70456 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfnO70456 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfnO70456 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfnO70456 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfnO70456 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfnO70456 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfnO70456 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfnO70456 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfnO70456 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfnO70456 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfnO70456 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfnO70456 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfnO70456 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SfnO70456 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfnO70456 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfnO70456 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfnO70456 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfnO70456 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfnO70456 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfnO70456 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfnO70456 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfnO70456 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfnO70456 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfnO70456 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfnO70456 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfnO70456 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfnO70456 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfnO70456 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfnO70456 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfnO70456 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfnO70456 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfnO70456 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfnO70456 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfnO70456 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfnO70456 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfnO70456 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfnO70456 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfnO70456 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfnO70456 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfnO70456 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfnO70456 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SfnO70456 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SfnO70456 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SfnO70456 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SfnO70456 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SfnO70456 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfnO70456 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfnO70456 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfnO70456 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfnO70456 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SfnO70456 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfnO70456 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfnO70456 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfnO70456 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfnO70456 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfnO70456 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfnO70456 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfnO70456 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms