Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3aO70157 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3aO70157 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3aO70157 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3aO70157 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3aO70157 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Top3aO70157 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top3aO70157 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3aO70157 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top3aO70157 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3aO70157 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms