Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd70O55237 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd70O55237 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd70O55237 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd70O55237 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd70O55237 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd70O55237 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd70O55237 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd70O55237 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd70O55237 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd70O55237 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms