Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OtogO55225 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OtogO55225 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtogO55225 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtogO55225 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtogO55225 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtogO55225 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtogO55225 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OtogO55225 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OtogO55225 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtogO55225 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtogO55225 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtogO55225 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtogO55225 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtogO55225 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtogO55225 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
OtogO55225 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtogO55225 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtogO55225 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtogO55225 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtogO55225 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtogO55225 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtogO55225 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtogO55225 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtogO55225 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtogO55225 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OtogO55225 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtogO55225 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtogO55225 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtogO55225 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtogO55225 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtogO55225 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtogO55225 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtogO55225 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OtogO55225 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OtogO55225 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OtogO55225 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OtogO55225 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OtogO55225 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OtogO55225 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OtogO55225 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OtogO55225 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OtogO55225 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OtogO55225 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OtogO55225 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
OtogO55225 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
OtogO55225 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OtogO55225 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OtogO55225 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OtogO55225 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OtogO55225 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
OtogO55225 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OtogO55225 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
OtogO55225 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OtogO55225 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
OtogO55225 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OtogO55225 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OtogO55225 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
OtogO55225 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
OtogO55225 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OtogO55225 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OtogO55225 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OtogO55225 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
OtogO55225 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
OtogO55225 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OtogO55225 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
OtogO55225 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
OtogO55225 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OtogO55225 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
OtogO55225 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtogO55225 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtogO55225 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtogO55225 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtogO55225 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtogO55225 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtogO55225 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
OtogO55225 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtogO55225 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtogO55225 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtogO55225 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtogO55225 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtogO55225 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OtogO55225 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtogO55225 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtogO55225 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtogO55225 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OtogO55225 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms