Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35aO55142 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl35aO55142 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms