Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nck2O55033 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nck2O55033 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nck2O55033 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nck2O55033 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nck2O55033 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nck2O55033 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nck2O55033 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nck2O55033 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nck2O55033 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nck2O55033 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nck2O55033 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms