Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Socs5O54928 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Socs5O54928 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Socs5O54928 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Socs5O54928 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Socs5O54928 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Socs5O54928 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Socs5O54928 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Socs5O54928 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Socs5O54928 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Socs5O54928 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Socs5O54928 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Socs5O54928 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Socs5O54928 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Socs5O54928 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Socs5O54928 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Socs5O54928 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Socs5O54928 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Socs5O54928 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Socs5O54928 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Socs5O54928 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Socs5O54928 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Socs5O54928 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Socs5O54928 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Socs5O54928 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Socs5O54928 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms