Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NfkbieO54910 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfkbieO54910 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NfkbieO54910 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms