Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EdaO54693 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EdaO54693 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EdaO54693 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EdaO54693 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EdaO54693 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EdaO54693 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EdaO54693 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EdaO54693 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EdaO54693 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EdaO54693 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EdaO54693 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EdaO54693 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EdaO54693 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EdaO54693 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EdaO54693 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EdaO54693 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EdaO54693 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EdaO54693 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EdaO54693 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EdaO54693 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EdaO54693 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EdaO54693 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EdaO54693 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EdaO54693 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EdaO54693 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EdaO54693 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EdaO54693 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EdaO54693 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EdaO54693 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EdaO54693 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EdaO54693 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EdaO54693 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EdaO54693 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EdaO54693 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EdaO54693 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EdaO54693 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EdaO54693 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EdaO54693 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EdaO54693 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EdaO54693 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EdaO54693 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EdaO54693 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EdaO54693 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EdaO54693 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EdaO54693 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EdaO54693 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EdaO54693 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EdaO54693 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EdaO54693 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EdaO54693 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EdaO54693 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EdaO54693 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EdaO54693 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EdaO54693 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EdaO54693 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EdaO54693 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EdaO54693 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EdaO54693 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EdaO54693 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EdaO54693 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EdaO54693 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EdaO54693 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EdaO54693 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EdaO54693 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EdaO54693 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EdaO54693 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EdaO54693 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EdaO54693 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EdaO54693 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EdaO54693 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EdaO54693 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EdaO54693 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EdaO54693 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EdaO54693 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EdaO54693 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EdaO54693 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EdaO54693 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EdaO54693 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EdaO54693 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EdaO54693 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EdaO54693 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EdaO54693 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EdaO54693 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EdaO54693 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EdaO54693 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EdaO54693 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EdaO54693 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EdaO54693 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EdaO54693 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EdaO54693 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EdaO54693 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EdaO54693 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EdaO54693 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EdaO54693 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EdaO54693 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EdaO54693 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EdaO54693 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EdaO54693 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EdaO54693 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms