Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Per1O35973 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Per1O35973 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Per1O35973 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Per1O35973 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Per1O35973 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Per1O35973 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Per1O35973 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Per1O35973 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Per1O35973 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Per1O35973 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Per1O35973 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Per1O35973 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Per1O35973 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Per1O35973 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Per1O35973 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Per1O35973 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Per1O35973 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Per1O35973 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Per1O35973 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Per1O35973 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Per1O35973 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Per1O35973 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Per1O35973 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Per1O35973 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Per1O35973 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Per1O35973 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Per1O35973 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Per1O35973 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Per1O35973 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Per1O35973 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Per1O35973 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Per1O35973 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Per1O35973 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Per1O35973 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Per1O35973 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Per1O35973 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Per1O35973 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Per1O35973 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Per1O35973 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Per1O35973 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Per1O35973 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Per1O35973 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Per1O35973 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Per1O35973 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Per1O35973 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Per1O35973 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Per1O35973 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Per1O35973 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Per1O35973 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Per1O35973 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Per1O35973 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Per1O35973 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Per1O35973 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Per1O35973 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Per1O35973 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Per1O35973 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Per1O35973 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Per1O35973 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Per1O35973 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Per1O35973 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Per1O35973 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Per1O35973 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Per1O35973 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Per1O35973 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Per1O35973 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Per1O35973 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Per1O35973 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Per1O35973 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Per1O35973 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Per1O35973 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Per1O35973 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Per1O35973 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Per1O35973 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Per1O35973 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Per1O35973 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Per1O35973 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Per1O35973 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Per1O35973 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Per1O35973 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Per1O35973 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Per1O35973 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Per1O35973 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Per1O35973 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Per1O35973 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Per1O35973 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Per1O35973 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Per1O35973 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Per1O35973 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms