Protein–RNA interactions for Protein: O35954

Pitpnm1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm1O35954 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pitpnm1O35954 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pitpnm1O35954 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pitpnm1O35954 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pitpnm1O35954 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms