Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdk5r2O35926 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdk5r2O35926 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdk5r2O35926 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms