Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pik3cdO35904 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pik3cdO35904 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pik3cdO35904 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3cdO35904 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms