Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sp100O35892 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp100O35892 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sp100O35892 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp100O35892 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sp100O35892 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp100O35892 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sp100O35892 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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