Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chil3O35744 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chil3O35744 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chil3O35744 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chil3O35744 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chil3O35744 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chil3O35744 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chil3O35744 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chil3O35744 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chil3O35744 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Chil3O35744 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chil3O35744 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chil3O35744 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms