Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf12O35738 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf12O35738 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf12O35738 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf12O35738 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf12O35738 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klf12O35738 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klf12O35738 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf12O35738 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf12O35738 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf12O35738 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klf12O35738 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms