Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NudcO35685 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NudcO35685 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NudcO35685 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NudcO35685 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NudcO35685 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NudcO35685 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NudcO35685 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NudcO35685 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NudcO35685 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NudcO35685 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NudcO35685 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NudcO35685 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NudcO35685 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NudcO35685 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NudcO35685 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NudcO35685 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NudcO35685 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NudcO35685 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NudcO35685 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NudcO35685 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NudcO35685 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NudcO35685 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NudcO35685 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NudcO35685 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NudcO35685 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NudcO35685 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NudcO35685 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NudcO35685 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NudcO35685 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NudcO35685 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NudcO35685 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NudcO35685 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NudcO35685 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NudcO35685 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NudcO35685 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NudcO35685 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NudcO35685 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NudcO35685 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NudcO35685 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NudcO35685 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NudcO35685 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NudcO35685 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NudcO35685 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NudcO35685 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NudcO35685 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NudcO35685 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NudcO35685 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NudcO35685 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NudcO35685 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NudcO35685 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NudcO35685 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NudcO35685 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NudcO35685 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NudcO35685 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NudcO35685 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NudcO35685 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NudcO35685 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NudcO35685 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NudcO35685 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NudcO35685 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NudcO35685 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NudcO35685 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NudcO35685 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NudcO35685 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NudcO35685 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NudcO35685 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NudcO35685 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NudcO35685 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NudcO35685 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NudcO35685 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NudcO35685 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NudcO35685 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NudcO35685 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NudcO35685 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NudcO35685 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NudcO35685 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NudcO35685 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NudcO35685 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NudcO35685 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NudcO35685 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NudcO35685 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NudcO35685 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NudcO35685 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NudcO35685 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NudcO35685 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NudcO35685 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NudcO35685 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NudcO35685 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NudcO35685 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms