Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrt1O35449 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt1O35449 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrt1O35449 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms