Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CrcpO35427 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CrcpO35427 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CrcpO35427 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CrcpO35427 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CrcpO35427 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CrcpO35427 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CrcpO35427 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CrcpO35427 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CrcpO35427 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CrcpO35427 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CrcpO35427 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CrcpO35427 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CrcpO35427 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms