Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc16a8O35308 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc16a8O35308 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc16a8O35308 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms