Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf2O35218 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf2O35218 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpsf2O35218 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms