Protein–RNA interactions for Protein: O08791

Ebf3, Transcription factor COE3, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3O08791 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ebf3O08791 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ebf3O08791 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ebf3O08791 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ebf3O08791 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms