Protein–RNA interactions for Protein: O08739

Ampd3, AMP deaminase 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd3O08739 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ampd3O08739 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ampd3O08739 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ampd3O08739 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms