Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efna5O08543 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efna5O08543 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efna5O08543 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Efna5O08543 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efna5O08543 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Efna5O08543 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna5O08543 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efna5O08543 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna5O08543 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna5O08543 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna5O08543 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Efna5O08543 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efna5O08543 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna5O08543 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efna5O08543 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Efna5O08543 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna5O08543 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna5O08543 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Efna5O08543 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms