Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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Gm20939L7N243 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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Gm20939L7N243 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Gm20939L7N243 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm20939L7N243 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Gm20939L7N243 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20939L7N243 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Gm20939L7N243 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Gm20939L7N243 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Gm20939L7N243 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm20939L7N243 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm20939L7N243 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20939L7N243 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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