Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp955bL7N232 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp955bL7N232 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp955bL7N232 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms