Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al1oL7MU04 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al1oL7MU04 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al1oL7MU04 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms