Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3402K7N5P2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm3402K7N5P2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm3402K7N5P2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms