Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spin2fJ3QPU0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spin2fJ3QPU0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin2fJ3QPU0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms