Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21797J3QNW5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm21797J3QNW5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21797J3QNW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21797J3QNW5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21797J3QNW5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21797J3QNW5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21797J3QNW5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21797J3QNW5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21797J3QNW5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms