Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm3336J3QMQ6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3336J3QMQ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3336J3QMQ6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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