Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21897J3KMP5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gm21897J3KMP5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms