Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp408H7BX78 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp408H7BX78 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp408H7BX78 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms