Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2b1G5E829 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2b1G5E829 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b1G5E829 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms